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Seminário de Fisica Estatistica
Sexta-feira, dia 08/04, a ser realizado na sala A5-01 às 16 horas.

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Padrões de Organização do Genoma
Nestor Oiwa - UFF-Friburgo

Tratamos o conjunto de letras ATCG (nucleotídeos ou pares de bases) do código
genético como sequências binárias e passeios aleatórios e, então, estudamos tais séries com métodos não-lineares. Abordamos as sequências de nucleotídeos depositados no GenBank (http://www.ncbi.nih.gov/) do DNA cromossômico e mitocondrial tanto
de organismos multicelulares (3% do genoma humano, genoma completo do verme
Caenorhabditis elegans, etc) como também de bactérias, incluindo o genoma completo
da Xylella fastidiosa, Xanthomonas citri e campestre. As análises multifractal e de
correlação em um total de 500 milhões de nucleotídeos revelam estruturas ocultas na
organização do genoma. As sequências não-codificantes do genoma, conhecidos “junk
DNA,” são responsáveis pela auto-similaridade na distribuição dos genes nos organismos superiores, indicando a existência de uma regra simples nos clusters de genes. Ainda nos organismos multicelulares, encontramos uma correlação
entre genes distantes em pelo menos 10 mil pares de bases. Essas estruturas estão
ausentes em bactérias, demonstrando que a organização genética nos eucariotos superiores é mais
complexa do que em bactérias. Além disso, reportamos que as palavras palindrômicas,
comuns no genoma, formam um mosaico multifractal. Os palíndromos expressam
o código genético dobrando a dupla hélice em loops, presentes na composição de
moléculas como o RNA de transferência (tRNA), ribossomos (rRNA), etc.
Nota: os palíndromos são palavras lidas de frente para trás ou vice-versa.